肠道不但主宰了健康，肠道菌群的影响，更可能“三岁定八十”。香港中文大学一项研究指出，妈妈在怀孕时期，会把自己独特的肠道微生物群遗传给婴儿。妈妈的健康，包括饮食习惯和食物添加剂等环境因素，可影响婴儿的肠道菌群；而婴儿出生前后数周的环境与早期体内的微生物，皆影响婴儿日后长期的免疫和代谢发展，当中包括患上克隆氏症、自闭症、肥胖、糖尿病等其他免疫相关的疾病风险。瑞士伯恩大学的一项研究亦指出，孕妇的肠道菌群在怀孕期间，会影响胎儿的免疫系统发育。研究发现虽然孕妇的子宫提供无菌的环境让胚胎及胎儿生长，但胎盘却仅具保护作用，胎儿无法抵抗来自母体肠道菌群的代谢物，进而影响胎儿免疫系统的发展。
另外，美国维珍尼亚大学医学院在国际医学期刊《免疫学期刊》上发表的研究也指出，妈妈肠道菌群除了影响婴儿的大脑发育，对调整子女的免疫系统也起到重要作用。假如妈妈肠道菌群不健康，由免疫系统产生的一种炎症分子白细胞介素-17a（Interleukin-17a），是引发自闭症的一个关键因素，婴儿日后出现自闭症以及神经发育障碍的风险比较高。
肠道微生物群的重要性可媲美人类的基因图谱，妈妈要保护子女的肠道微生物，须从怀孕期开始调整饮食，通过平衡肠道微生态，为胎儿提供一个健康、有利的生长环境。
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